Вакцинные эмульсии обратного типа представляют собой непрерывную фазу (углеводородное минеральное масло с эмульгатором), содержащую в себе дисперсную фазу в виде мельчайших капель водного раствора антигена. Сотрудниками ФГУ «Федеральный центр охраны здоровья животных» (ФГУ ВНИИЗЖ) (г. Владимир) показана прямая зависимость активности подобных эмульсий (продолжительности иммунного ответа) от размеров частиц действующего вещества (антигена): чем выше дисперсность раствора антигена, тем более выражен иммунный ответ. Размеры капель дисперсной фазы эмульсии не должны превышать 5 мкм; из более грубых эмульсий захват водно-масляных комплексов вакцины макрофагами и их включение в иммунный механизм происходит гораздо менее эффективно.
При хранении эмульсионных вакцин протекают процессы, приводящие к нарушению стабильности водно-масляной системы. Такие изменения носят как обратимый (флокуляция), так и необратимый характер (коалесценция). Для контроля этих нежелательных явлений необходимо проведение мониторинга физико-химических свойств эмульсионных препаратов во время их хранения.